1 motako diabetesarekin asoziaturiko RNA ez kodetzaile batek mikropeptido bat ekoiztu dezake

Abstract

1 motako diabetesa oso zabaldurik dagoen eritasun autoimmune multifaktorial bat da, zeinean infekzio enterobiralek patologiaren garapenean eragiten duten genetikoki suszeptibleak diren indibiduoetan. Testuinguru honetan, ohituraz ez kodetzaile gisa sailkatzen diren RNA geneetatik ekoiztu litezkeen mikropeptidoak gaixotasunaren garapenean garrantzitsuak izan litezkeela uste dugu. Hipotesi honekin, erribosomei atxikiriko RNAren sekuentziazioa burutu dugu pankreako ß zelulen lerro batean, infekzio birala imitatzen duen baldintzen pean. Tresna bioinformatikoen bidez mikropeptidoren bat kodetzeko aukera duten hautagaien zerrenda bat lortu ez ezik, metodoa balioztatu dugu hautagai batetik eratorritako peptido baten ekoizpena in vitro frogaturik. 1motako diabetesa, RNA luze ez kodetzailea, mikropeptidoak, pankreako ß zelulak

Type 1 diabetes is a chronic, multifactorial and autoimmune disease in which enteroviral infections seem to be a crucial triggering factor in genetically susceptible individuals. Although traditionally disregarded, non-coding RNAs have emerged as key players in the disease, especially those which can produce small peptides from short open reading frames. In this study we have sequenced ribosome-bound RNA in a pancreatic ß cell line under basal and viral-insult-mimicking conditions. By usage of several bioinformatical tools, we have generated a list of RNA gene candidates with micropeptide coding potential. Additionally, we have validated this approach in vitro by identifying a non-coding RNA gene which can produce a putative 109 aminoacid peptide. Type 1 diabetes, long non-coding RNA, micropeptides, pancreatic ß cells