Aljeriako behien nodulu linfatikoetatik isolatutako Pseudochrobactrum algeriensis espezie berriaren deskribapena eta Pseudochrobactrum generoa identifikatzeko tresna molekularraren garapena

Abstract

Bruzelosi azterketa bakteriologiko batean, Brucella ez ziren hiru andui isolatu ziren Aljeriako behi batzuen nodulu linfatikoetatik. Diagnostiko tresna klasikoekin ez zen lortu bakterio horiek identifikatzea. Genomaren analisietan oinarrituta, isolatuak ia berdin-berdinak ziren eta Pseudochrobactrum generoan sartzen ziren, Brucellatik oso hurbil dagoen generoa, Brucella ugaztun ezberdinak kutsa ditzakeen bakterio zoonotikoa izanik. Datu genomiko, fisiologiko eta biokimikoen arabera, organismo horiek Pseudochrobactrum generoko espezie berri bat osatzen dute, eta Pseudochrobactrum algeriensis izena proposatu zen. 16S-PsO-F/R hasle bikote berria 16S rRNA genean oinarritzen da eta espezifikoki Pseudochrobactrum espezie guztiak detektatzen ditu.During a brucellosis bacteriological survey three strains were isolated from lymph nodes of Algerian cows. Classical diagnostic tools did not attribute the isolates to any known species. On the basis of genome analyses the isolates were almost identical and clearly grouped in the genus Pseudochrobactrum, a genus phylogenetically very close to Brucella, a zoonotic bacteria able to infect different mammals. Genomic, physiological and biochemical data supported that these organisms represent a novel species of the genus Pseudochrobactrum, for which the name Pseudochrobactrum algeriensis sp. is proposed. The new 16S-PsO-F/R pair of primers is based on 16S rRNA gene and specifically detects all the Pseudochrobactrum species.