Ardiaren 21 ehunetan karakterizatutako eta kuantifikatutako miRNA molekulen adierazpenaren banaketaren azterketa

Abstract

MikroRNA molekulak (miRNA) eboluzioan zehar kontserbatuta dauden eta gene-adierazpena erregulatzen duten RNA ez-kodetzaile txikiak dira. Ardian, beste etxe-abereekin konparatuta, miRNA gutxi deskribatu dira. Lan honetan, datu-baseetan argitaratuta dauden ardiaren 21 ehunetako 172 miRNA-seq lagin era uniformean analizatu ditugu, miRNA berrien eta kontserbatuen adierazpen profilak aztertzeko. Aztertutakoen artean, 270 miRNA molekulek ehun espezifikotasun indizearen balio altuak azaldu zituzten. Gainera, hausnarkarien espezifikoa den mir-2284/mir-2285 miRNA familiako 100 miRNA inguru detektatu ziren. Lan honek miRNA askoren kontserbazio maila altuaren ideiarekin bat dator, baina aldi berean hausnarkarien eboluzioan klado-espezifikoak diren berrikuntzen potentziala azpimarratu du.

MicroRNAs (miRNAs) are evolutionarily conserved small non-coding RNAs that regulate gene expression. In sheep, few miRNAs have been described compared with other livestock species. We uniformly analyzed 172 public ovine miRNA-seq datasets from 21 different tissues in order to predict conserved and novel miRNA precursors and profile their expression patterns. 270 miRNAs showed high tissue specificity index values. Strikingly, over 100 precursors from the ruminant-specific family of mir-2284/mir-2285 miRNAs were found. This work supports the known high evolutionary conservation of many miRNAs, but also highlights the potential of clade-specific innovations in ruminant evolution.